我们国家的冷链物流市场处在发展过程，带来了非常大的发展机会，但是同时参与进来的公司也遭遇风险性与挑战。这种风险主要来自于比较大的投入和对冷链物流市场特征的掌握。
我国目前还是属于轻资产市场竞争自然环境，从业冷链运输必须冻库或冷冻汽车的资金分配，相较于其他行业，从业冷链运输的投入大得多。建造冷库，买冷藏车投入相较于一般干货物流会增加2到3倍，因此资金投入与回报风险性较大。冷链运输也是包括比较多致冷与隔热保温技术与管理知识的行业，对冷链技术的把握与现代的物流信息管理方式与方法的应用从事冷链运输不可或缺的基本条件。不具有冷链物流运行的基本条件和没掌握冷链市场的基本特点而轻率进到冷链运输行业也会面临比较大的风险性。
一些企业如果没有适度的控制方法，并且用的根据挑选合理控制规范，仅以超标的提升原本满足用户的规定，因此运营成本持续上升。冷链运输的经营成本和所承载的物品成本费相对性其他行业也比较高，因此错误和不成功所带来的损失也相应增加。
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现阶段，在我国尚未形成详细单独的物流配送体系，冷链运输的高速发展还只停留在运送与冷冻阶段，应用信息技术的冷链物流管理管理体系还明显不足，技术设备比较落后；冷链运输成本相对来说价格昂贵，一般是由物流成本、仓储费用、库存成本和人力成本构成，在其中物流成本与仓储费用占比比较大，存有监管落实不到位、国家标准不统一等一系列问题。例如：运输中关闭制冷机组以降低成本；运送装货环节中实际操作落实不到位造成温度太高。